"sc.pp.filter_cells(adata, min_genes=200)\n", "sc.pp.filter_genes(adata, min_cells=3)" ...

私はMD, PhDで今は米国に留学中です。研究者としての業務は完全に細胞や動物や臨床検体を扱う仕事ですが、近年のバイオインフォマティクスの波に飲まれ、既存のパッケージを利用して、与えられたfastqデータから、シングルセル解析のfigの出力くらいまで ...

"https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html\n", "wget http://cf.10xgenomics.com/samples/cell-exp/1.1.0/pbmc3k/pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices.tar ...

私は医者で臨床を数年やって、その後大学院で研究を始めました。働き方改革の波が私のところに到達するのは少し遅かったみたいで、わりと過酷な労働環境で働いてきたと自負しています。分野は癌です。大学院の時は臨床研究と、細胞とモデルマウスを ...