Axes.plot() はプロットした line2d のリストを返す。線が一本で中身だけ受け取りたいときは、変数にカンマ(,)をつければオーケー。 Axes.get_lines() で、Axes にそれまでにプロットされた line2d のリストが得られる。 見た目を一気に整えたい時にいいかも。
シンプルなデータについては、numpyを使うのが一番簡単ではないかという気がしています。numpyはmatplotlibの動作に必須なので、matplotlibを使える方はすでにインストール済みのはずです。 numpy.loadtxt は、データ欠損がない時に使えます。データに飛びがある時 ...